Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM8Q9BZR9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms