Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMEM79Q9BSE2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms