Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TREX2Q9BQ50 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TREX2Q9BQ50 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms