Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CLCC1Q96S66 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms