Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UTP4Q969X6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms