Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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CLDN19Q8N6F1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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CLDN19Q8N6F1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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CLDN19Q8N6F1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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CLDN19Q8N6F1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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CLDN19Q8N6F1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN19Q8N6F1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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