Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC6BQ86SZ2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms