Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEM1Q6ZVN7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms