Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q56UQ5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q56UQ5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Q56UQ5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q56UQ5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q56UQ5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q56UQ5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q56UQ5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Q56UQ5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q56UQ5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q56UQ5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q56UQ5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q56UQ5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q56UQ5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q56UQ5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q56UQ5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q56UQ5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q56UQ5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Q56UQ5 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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