Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TWISTNBQ3B726 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms