Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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CTF1Q16619 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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CTF1Q16619 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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CTF1Q16619 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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CTF1Q16619 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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CTF1Q16619 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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CTF1Q16619 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CTF1Q16619 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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