Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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PTPRRQ15256 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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PTPRRQ15256 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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PTPRRQ15256 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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PTPRRQ15256 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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PTPRRQ15256 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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PTPRRQ15256 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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PTPRRQ15256 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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PTPRRQ15256 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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PTPRRQ15256 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRRQ15256 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
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