Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERPUD1Q15011 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERPUD1Q15011 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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