Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SMC1AQ14683 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMC1AQ14683 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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