Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF2H3Q13889 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms