Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MRPL28Q13084 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms