Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AP1B1Q10567 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms