Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCRN3Q0VDG4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms