Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC15Q0P6D6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC15Q0P6D6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms