Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NCBP1Q09161 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms