Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM27E3Q08E93 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms