Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPOCK1Q08629 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms