Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDR1Q08345 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDR1Q08345 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms