Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EGR4Q05215 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms