Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DHODHQ02127 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms