Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DEFA6Q01524 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DEFA6Q01524 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms