Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTBSQ01459 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBSQ01459 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms