Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIPK4P57078 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RIPK4P57078 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms