Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PIP4K2AP48426 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PIP4K2AP48426 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms