Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HOXD13P35453 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms