Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSPA4P34932 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HSPA4P34932 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HSPA4P34932 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HSPA4P34932 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HSPA4P34932 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPA4P34932 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms