Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCLP19338 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCLP19338 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCLP19338 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCLP19338 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCLP19338 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCLP19338 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCLP19338 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCLP19338 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NCLP19338 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCLP19338 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCLP19338 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCLP19338 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCLP19338 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCLP19338 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCLP19338 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCLP19338 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCLP19338 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCLP19338 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms