Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAV1P15498 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAV1P15498 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAV1P15498 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAV1P15498 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms