Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGAMP11215 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms