Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APODP05090 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APODP05090 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APODP05090 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APODP05090 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APODP05090 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APODP05090 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APODP05090 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APODP05090 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APODP05090 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APODP05090 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APODP05090 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APODP05090 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APODP05090 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APODP05090 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
APODP05090 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APODP05090 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
APODP05090 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APODP05090 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APODP05090 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APODP05090 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APODP05090 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
APODP05090 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
APODP05090 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APODP05090 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APODP05090 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APODP05090 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APODP05090 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APODP05090 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APODP05090 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
APODP05090 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APODP05090 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APODP05090 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APODP05090 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APODP05090 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APODP05090 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APODP05090 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APODP05090 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APODP05090 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APODP05090 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APODP05090 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APODP05090 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms