Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
B4DXG7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
B4DXG7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
B4DXG7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
B4DXG7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms