Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
THRAP3Q9Y2W1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
THRAP3Q9Y2W1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms