Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOMER3Q9NSC5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms