Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GPCPD1Q9NPB8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
GPCPD1Q9NPB8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GPCPD1Q9NPB8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPCPD1Q9NPB8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPCPD1Q9NPB8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPCPD1Q9NPB8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPCPD1Q9NPB8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPCPD1Q9NPB8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPCPD1Q9NPB8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPCPD1Q9NPB8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPCPD1Q9NPB8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPCPD1Q9NPB8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GPCPD1Q9NPB8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms