Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms