Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NIFKQ9BYG3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NIFKQ9BYG3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms