Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TDRD1Q9BXT4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms