Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCM2Q9BSQ5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCM2Q9BSQ5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCM2Q9BSQ5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCM2Q9BSQ5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCM2Q9BSQ5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCM2Q9BSQ5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCM2Q9BSQ5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCM2Q9BSQ5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCM2Q9BSQ5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCM2Q9BSQ5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCM2Q9BSQ5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCM2Q9BSQ5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCM2Q9BSQ5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCM2Q9BSQ5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCM2Q9BSQ5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms