Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF559Q9BR84 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms