Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PMCHL2Q9BQD1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PMCHL2Q9BQD1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms