Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEIS3Q99687 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEIS3Q99687 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms