Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MTERF3Q96E29 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms