Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP2A3Q93084 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms