Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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RABGGTAQ92696 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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RABGGTAQ92696 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
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RABGGTAQ92696 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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RABGGTAQ92696 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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RABGGTAQ92696 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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RABGGTAQ92696 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
RABGGTAQ92696 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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RABGGTAQ92696 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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RABGGTAQ92696 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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RABGGTAQ92696 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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RABGGTAQ92696 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RABGGTAQ92696 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
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