Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GTF3AQ92664 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms